Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RCC2Q9P258 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RCC2Q9P258 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RCC2Q9P258 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms