Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACD3Q9P035 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HACD3Q9P035 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD3Q9P035 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms