Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLGN3Q9NZ94 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLGN3Q9NZ94 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NLGN3Q9NZ94 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN3Q9NZ94 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms