Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GGA3Q9NZ52 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GGA3Q9NZ52 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GGA3Q9NZ52 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GGA3Q9NZ52 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GGA3Q9NZ52 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GGA3Q9NZ52 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GGA3Q9NZ52 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GGA3Q9NZ52 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GGA3Q9NZ52 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GGA3Q9NZ52 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GGA3Q9NZ52 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GGA3Q9NZ52 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GGA3Q9NZ52 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms