Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MRPL39Q9NYK5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MRPL39Q9NYK5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MRPL39Q9NYK5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms