Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCM9Q9NXL9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM9Q9NXL9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM9Q9NXL9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms