Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXC5

MIOS, GATOR complex protein MIOS, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIOSQ9NXC5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MIOSQ9NXC5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MIOSQ9NXC5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MIOSQ9NXC5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MIOSQ9NXC5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MIOSQ9NXC5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms