Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MKS1Q9NXB0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKS1Q9NXB0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MKS1Q9NXB0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms