Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK13-1Q9NX77 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERVK13-1Q9NX77 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERVK13-1Q9NX77 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms