Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SETD4Q9NVD3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SETD4Q9NVD3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD4Q9NVD3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD4Q9NVD3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms