Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UFSP2Q9NUQ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UFSP2Q9NUQ7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFSP2Q9NUQ7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFSP2Q9NUQ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFSP2Q9NUQ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UFSP2Q9NUQ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFSP2Q9NUQ7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UFSP2Q9NUQ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFSP2Q9NUQ7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFSP2Q9NUQ7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFSP2Q9NUQ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFSP2Q9NUQ7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFSP2Q9NUQ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFSP2Q9NUQ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UFSP2Q9NUQ7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
UFSP2Q9NUQ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UFSP2Q9NUQ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UFSP2Q9NUQ7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UFSP2Q9NUQ7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.2 ms