Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11L1Q9NUJ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11L1Q9NUJ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TCP11L1Q9NUJ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCP11L1Q9NUJ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms