Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GINM1Q9NU53 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GINM1Q9NU53 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GINM1Q9NU53 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GINM1Q9NU53 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms