Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
RRP7BPQ9NSQ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
RRP7BPQ9NSQ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
RRP7BPQ9NSQ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms