Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A11Q9NSA0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A11Q9NSA0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A11Q9NSA0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms