Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS4Q9NRS4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMPRSS4Q9NRS4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms