Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDHAF3Q9NRP4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDHAF3Q9NRP4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SDHAF3Q9NRP4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms