Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
DUOX2Q9NRD8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
DUOX2Q9NRD8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
DUOX2Q9NRD8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
DUOX2Q9NRD8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
DUOX2Q9NRD8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
DUOX2Q9NRD8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
DUOX2Q9NRD8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.87■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
DUOX2Q9NRD8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.82■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
DUOX2Q9NRD8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
DUOX2Q9NRD8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
DUOX2Q9NRD8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
DUOX2Q9NRD8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
DUOX2Q9NRD8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
DUOX2Q9NRD8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
DUOX2Q9NRD8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
DUOX2Q9NRD8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
DUOX2Q9NRD8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
DUOX2Q9NRD8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
DUOX2Q9NRD8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
DUOX2Q9NRD8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
DUOX2Q9NRD8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
DUOX2Q9NRD8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
DUOX2Q9NRD8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
DUOX2Q9NRD8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms