Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC52A3Q9NQ40 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC52A3Q9NQ40 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC52A3Q9NQ40 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms