Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDHHC4Q9NPG8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDHHC4Q9NPG8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms