Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VTA1Q9NP79 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VTA1Q9NP79 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
VTA1Q9NP79 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VTA1Q9NP79 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms