Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20AQ9NP66 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HMG20AQ9NP66 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HMG20AQ9NP66 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms