Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP4F12Q9HCS2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYP4F12Q9HCS2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYP4F12Q9HCS2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYP4F12Q9HCS2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms