Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CENPJQ9HC77 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CENPJQ9HC77 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CENPJQ9HC77 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CENPJQ9HC77 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CENPJQ9HC77 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms