Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UPF2Q9HAU5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
UPF2Q9HAU5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC29■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
UPF2Q9HAU5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
UPF2Q9HAU5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms