Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS7BQ9H9Q2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7BQ9H9Q2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS7BQ9H9Q2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms