Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VIPAS39Q9H9C1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VIPAS39Q9H9C1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms