Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
WDR55Q9H6Y2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDR55Q9H6Y2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
WDR55Q9H6Y2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR55Q9H6Y2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR55Q9H6Y2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR55Q9H6Y2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR55Q9H6Y2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR55Q9H6Y2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR55Q9H6Y2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR55Q9H6Y2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDR55Q9H6Y2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDR55Q9H6Y2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms