Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6W3

RIOX1, Ribosomal oxygenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX1Q9H6W3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RIOX1Q9H6W3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIOX1Q9H6W3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RIOX1Q9H6W3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RIOX1Q9H6W3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms