Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00597Q9H2U6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00597Q9H2U6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms