Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIK2Q9H0K1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIK2Q9H0K1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms