Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LSG1Q9H089 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LSG1Q9H089 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LSG1Q9H089 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LSG1Q9H089 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms