Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLR2J2Q9GZM3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2J2Q9GZM3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms