Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPESC1Q9GZL8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPESC1Q9GZL8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPESC1Q9GZL8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
BPESC1Q9GZL8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BPESC1Q9GZL8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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