Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J1

B3GNT4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT4Q9C0J1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B3GNT4Q9C0J1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3GNT4Q9C0J1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
B3GNT4Q9C0J1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B3GNT4Q9C0J1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
B3GNT4Q9C0J1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B3GNT4Q9C0J1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT4Q9C0J1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT4Q9C0J1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT4Q9C0J1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT4Q9C0J1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT4Q9C0J1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT4Q9C0J1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT4Q9C0J1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B3GNT4Q9C0J1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms