Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHACTR1Q9C0D0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHACTR1Q9C0D0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHACTR1Q9C0D0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms