Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE2OQ9C0C9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE2OQ9C0C9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE2OQ9C0C9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE2OQ9C0C9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE2OQ9C0C9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBE2OQ9C0C9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2OQ9C0C9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2OQ9C0C9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2OQ9C0C9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2OQ9C0C9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2OQ9C0C9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2OQ9C0C9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBE2OQ9C0C9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2OQ9C0C9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
UBE2OQ9C0C9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UBE2OQ9C0C9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE2OQ9C0C9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2OQ9C0C9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2OQ9C0C9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE2OQ9C0C9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE2OQ9C0C9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE2OQ9C0C9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE2OQ9C0C9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2OQ9C0C9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2OQ9C0C9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms