Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMBRA1Q9C0C7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AMBRA1Q9C0C7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms