Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EDEM3Q9BZQ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EDEM3Q9BZQ6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EDEM3Q9BZQ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms