Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BCO2Q9BYV7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCO2Q9BYV7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCO2Q9BYV7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCO2Q9BYV7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCO2Q9BYV7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCO2Q9BYV7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCO2Q9BYV7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCO2Q9BYV7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCO2Q9BYV7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCO2Q9BYV7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCO2Q9BYV7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BCO2Q9BYV7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BCO2Q9BYV7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCO2Q9BYV7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCO2Q9BYV7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCO2Q9BYV7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BCO2Q9BYV7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BCO2Q9BYV7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BCO2Q9BYV7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BCO2Q9BYV7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms