Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSPO3Q9BXY4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSPO3Q9BXY4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RSPO3Q9BXY4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms