Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS5

AP1M1, AP-1 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1M1Q9BXS5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP1M1Q9BXS5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
AP1M1Q9BXS5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP1M1Q9BXS5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AP1M1Q9BXS5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AP1M1Q9BXS5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms