Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC12A9Q9BXP2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC12A9Q9BXP2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC12A9Q9BXP2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms