Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM2Q9BVW6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM2Q9BVW6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms