Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM62Q9BVG3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM62Q9BVG3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM62Q9BVG3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms