Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV73

CEP250, Centrosome-associated protein CEP250, humanhuman

Predictions only

Length 2,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP250Q9BV73 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEP250Q9BV73 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP250Q9BV73 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP250Q9BV73 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEP250Q9BV73 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEP250Q9BV73 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP250Q9BV73 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP250Q9BV73 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms