Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNPY3Q9BT09 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CNPY3Q9BT09 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 414.6 ms