Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTKNQ9BST9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTKNQ9BST9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTKNQ9BST9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms