Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NIPSNAP3BQ9BS92 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NIPSNAP3BQ9BS92 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms