Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDF4Q9BRK5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.58■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SDF4Q9BRK5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SDF4Q9BRK5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDF4Q9BRK5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms